灵体之乱，天外之乱在新纪元558年4月，持续了一年的战争戛然而止。众多灵体迁移至西方，在至高神（使徒）的号召下一个个神国，在众神之下一切种族供奉信仰之力，当然也有战争，谁的信仰不够虔诚，自然给予周围的种族讨伐对神不虔诚的种族。当然在战争中狂信徒担任的牧师被优待。
诸多灵体统一撤离至欧洲和美洲大陆后，用力量让各大种族畏惧，用相互战争的恐惧时刻点醒每个种族自身的危机，必须要依靠神。这是一种高超的统治艺术。
这个时代是神的时代，非洲的鳄鱼人，森林人，地中海的鱼人，光明之城的西方人类。大西洋上各种各样的海族。沙漠中的蜥蜴人。在这个时期，潮湿充满海苔味的洞窟，干燥充满风沙的石壁，或者是宏伟辉煌的城墙中，都架起来神像。自双神陨落后百族林立发展的黄金时代过去后，提前了二十年的诸神时代到来了（之所以提前，是魔方投放的穿越者玩的）。
但是在东方这片土地上没有像原剧情中出现几个神明统治，东亚大陆上的灵气文明经历了这场挫折，依然在黄金时代上前进。至于为什么，地球上的小天位和强天位不知道。
最后在上海地区，程攀逼压使徒的风采，除了其他行星地区的三阶发现到了。已经程攀和四个二阶说过，其他无人可知。在月球上使徒公开施放巨大的虚影，已经让所有人知道他的形象了，月球上的探测器时刻锁定的这个高能区域，但是后来，东海地区这个猛然冒出来的强大生物似乎在和什么恐怖的东西战斗，由于远程望远镜无法具体探测目标，程攀由不像使徒那么骚包，全身能量丝毫不泄露。
之后似乎发生了超级庞大的爆炸，仿佛整个大气像是布满了高爆燃气一样，半圆形的光球如同肿瘤一般扩张起来。但是这个肿瘤一样长达上百公里的光斑消失后，大地突然赤红，代表使徒的流光朝着非洲大陆飞过去，一切都结束。
使徒为了信仰里当然不会宣扬自己被打败的事情，而程攀重新输入重重验证，进入月球基地的时候宛若如隔三秋。死亡的经历是会让人成长。几个月前自己还抱着对前途不可测的畏惧，在这个位面畏畏缩缩的探索。
程攀洒脱的一笑，大步流星的走进总指挥室。程攀放开一切的冲进了未知的未来，不仅让自己放开一切进入三阶，同时也给本位面继承文明的后来者在黑暗的前方点燃了一盏灯。
“当自我生命体系中原本传讯的量子波动，可以完美控制的时候。你们应该就可以达到了。”程攀对四位二阶教导道，说至这样说，但是做十分困难，大脑思维运转散发的量子波动非常复杂，一小点思维颤动，这个量子波动就受到剧烈影响。如果说计算壹加壹，引起的脑波波动是大海中的一个海浪，而细微控制量子波动就是控制一个小小的浪花闪现的形状和时间。
如果说普通人想事情构架思维引起的量子波动就是在一个无风平静的小池塘中，用手拨动水波，控制水波在平静的水面上波动。而程攀的量子基因就是相当于控制了整片大海，这种控制不是控制海啸一样的水浪，也不是如同控制大风气流一样控制刮起风浪的高度，而是每一个微小波浪的抖动的形状和高度不差一丝一毫。预测众多波浪相互干扰，叠加的程度。
沈彩蝶他们的体内的量子现象现在可以被机械探查到。但是想要不断控制，掌握，非常难，或者克服枯燥，降服心猿，苦练是一种道路。但是没有绝强的大毅力无法做到。
当程攀身上的量子现象受到程攀的控制，在仪器上的复杂表现出来时，沈彩蝶他们见识到了更高级别的力量到底是什么样的水平。
程攀非常相信这四位二阶，不是他们的忠诚点数满了，而是只要他们有理智存在就绝对不会自绝前途。在没有量子基因彻底打开着原子力量源泉之前，二阶基因锁的战斗力依靠的是工具。而在被程攀强行带到认知道路上的一二阶基因锁们，理解到最强的工具不是什么天外的上古遗留的神器，而是自己搞得懂，能制造，自己组成工业体系能不断更新创造的工具。
背靠工业体系造工具碾压世界，比靠着运气找神器碾压世界要靠谱的多。所以现在认知文明高层全都是工业狂，尤其是知道人计划二阶阶段“法力”已经少量制造的二阶基因锁强者。现在刚刚被强天位和真魔级灵体压制的，常河等人，现在是工业文明前进的绝对支持者。
对于一阶二阶基因锁强者来说，自身的强大已经毋庸置疑，强大的思维控制能力，轻松熟练运用海量的知识。这种强大已经不需要周围人的说了，强就是强，在遨游空间以一压一百，是理所当然的。因为绝对的自信，所以不需要在平常生活中让普通人用形式上的敬礼致敬来体现。宝石不需要任何包装。
而所有的解开基因锁的强者放弃了踩人这种低级的趣味，至于一些服务的活，一些真人一样的机器人可以替代。而所有基因锁强者需要的是海量的人类散发自己的创意，和努力不断让工业体系升级。为了升级当然不能用七杂八杂的屈辱情绪，影响掌控工业体系中海量工人的感情。只有自发向上有希望的人群才能做好事情。
前进，为了工业体系带给自己力量，一些无所谓的高傲，高贵完全可以舍弃。况且大人不需要在孩子面前证明自己强悍。
而当三千万一阶基因锁加入桂树城的时候，带着死里逃生的情绪，这群人空前的团结在文明下。这一年四百亿试管婴儿开始培育。人口飙升的进度再次加强了。未来每个人都需要未来。人类之间现在只有爱情的争执才会引发矛盾冲突。
桂树城遨游空间中，庞大的太阳系立体星图为大环境，每个人如同沧海一粟一样在这个广阔的空间虚拟空间内漂浮，当火土城的最后一批移民到达的时候，桂树城中的原本的发言权被淹没了大半，当然桂树城中没有人会质疑这种制度。都是从十分之一死亡率中走出来的人。没有什么好嫉妒。
三千多万代表一阶基因锁的光点在虚拟的太空空间中只能算是一群光点。其中最明亮的光点是程攀。会议的内容只有一个确定敌人是什么。五百年前把人类的摇篮横空夺走的纯在就是敌人。
地母神也就是当初没入地球的巨大光影，在地球内部宛如生命状态的结构被程攀用光线指引，迅速原本灰色（现在地球大气就是这样）的地球内部立刻展现了能量流动的结构。这是程攀用超感一边探查地球，一边大致描绘出来的。
“这就是我们的敌人，差点造成我们文明断层的敌人。”随着光芒闪烁其他七大行星和小行星带中诸多陨石构成的复杂运动物质流中，同样的特殊非自然物理现象的物质移动结构，出现在所有人眼中。
黑暗森林或许谈不上，整个太阳系中各大行星，都变成滋生毒蛇的温床。现在初步爬出摇篮的人类文明手上必须要磨着刀子，和这些毒蛇斗争。